Certyfikacja wydatków na rzecz rozwoju regionu, koordynacja projektów dotyczących przebudowy dróg lokalnych i usuwania skutków powodzi na terenie województwa mazowieckiego to główne zadania Wydziału Certyfikacji i Funduszy Europejskich w 2011 r.

W wydziale stworzono zespół odpowiedzialny za obsługę przedsięwzięć związanych z usuwaniem skutków klęsk żywiołowych w infrastrukturze komunalnej i hydrotechnicznej. W wyniku pracy urzędników Jacek Kozłowski, wojewoda mazowiecki, przekazał w 2011 roku ponad 62 mln zł na realizację 152 inwestycji (w ramach Funduszu Solidarności Unii Europejskiej, za ponad 14 mln zł, zrealizowano 61 projektów). Za przekazane samorządom środki powstały m.in. dwie drogi w gminie Korczew (powiat siedlecki), które uchronią miejscowości Bużyska, Mogielnica i Szczeglacin przed kolejnymi zalaniami i podtopieniami. 10,6 km dróg na odcinkach: Korczew – Przekop – Drażniew i Mogielnica – Szczeglacin dofinansowano kwotą 8,6 mln zł. Ponad 3 mln zł dotacji wykorzystano na remonty i odbudowy mostów w miejscowościach: Stary Młyn (gmina Przytyk), Gostomina (Nowe Miasto nad Pilicą) oraz na drodze gminnej między Studzieńcem a Zyckiem Nowym (Słubice). Odnowiono także most we Władysławowie (gmina Sochaczew). Wojewódzki Zarząd Melioracji i Urządzeń Wodnych w Warszawie wyremontował zalane podczas powodzi pompownie „Dobrzyków II” oraz „Wiączemin”. 3,8 mln zł dotacji spożytkowano na przebudowę wałów przeciwpowodziowych doliny Chmielewo (powiat płocki).

Urzędnicy koordynowali realizację i rozliczenie 70 inwestycji w ramach "Narodowego Programu Przebudowy Dróg Lokalnych 2008-2011". Łączna wartość projektów przedsięwziętych przez samorządy w roku 2011 wyniosła ponad 92 mln zł - udało się zmodernizować lub wybudować ponad 220 km dróg gminnych i powiatowych. Pracownicy wydziału dokonali także oceny formalnej ponad 150 wniosków o dofinansowanie zadań jednostek samorządu terytorialnego na potrzeby realizacji "Narodowego programu przebudowy dróg lokalnych - Etap II Bezpieczeństwo - Dostępność - Rozwój".

Zadaniem – delegowanym przez Ministerstwo Rozwoju Regionalnego - na Wydział Certyfikacji i Funduszy Europejskich Mazowieckiego Urzędu Wojewódzkiego jest certyfikacja prawidłowości wydatków z Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Mazowieckiego na lata 2007 – 2013 (RPO WM), którego główny cel to poprawa konkurencyjności  i zwiększanie spójności społecznej, gospodarczej i przestrzennej województwa. W wyniku weryfikacji tych środków w 2011 roku scertyfikowano do Komisji Europejskiej wydatki w łącznej kwocie ok. 1,16 mld zł. Fundusze z UE umożliwiły rozbudowę m.in. drogi wojewódzkiej nr 637 relacji Warszawa – Węgrów (ok. 18 mln zł scertyfikowanych wydatków), drogi wojewódzkiej nr 617 relacji Przasnysz – Ciechanów (ok. 21 mln zł scertyfikowanych wydatków) i  drogi wojewódzkiej nr 724 relacji Warszawa – Góra Kalwaria (ok. 38 mln zł scertyfikowanych wydatków). Dofinansowanie wykorzystano także przy modernizacji ul. Modlińskiej w Warszawie (ok. 22 mln zł scertyfikowanych wydatków).

Przeprowadzano także szkolenia m.in. dla beneficjentów "Narodowego Programu Przebudowy Dróg Lokalnych 2008-2011". W trakcie warsztatów ponad 60 uczestników uzyskało informacje na temat procesu realizacji projektu ze szczególnym uwzględnieniem zasad rozliczania, monitorowania, sprawozdawczości oraz kontroli inwestycji.

Pracownicy Wydziału Certyfikacji i Funduszy Europejskich przeprowadzili 127 kontroli. 56 z nich w ramach programu "Narodowego Programu Przebudowy Dróg Lokalnych 2008-2011”, 48 w ramach działań związanych z usuwaniem skutków klęsk żywiołowych, finansowanych ze środków budżetu państwa. Dotyczyły one stanu zaawansowania prac inwestycyjnych i wydatkowania funduszy. W ramach Zintegrowanego Programu Rozwoju Regionalnego odbyły się 23 kontrole. Projekty sprawdzano pod kątem zabezpieczenia trwałości inwestycji przez podmioty publiczne – przez okres pięciu lat nie mogą one bowiem zostać poddane zasadniczej modyfikacji.